海邊，冰冷的海風夾雜著雨點，空氣中叫囂著刺耳地警笛聲，一大群警察和圍觀者在海邊忙碌著。警局里，慧娜的母親在等待著結果，這時，有警察拿著書包進來問她這是不是慧娜的。慧娜的母親看著書包上女兒的信息，一時不知該如何反應。

鏡頭轉到，慧娜失蹤的一個月前，鳥科博士秀珍所在的研究所關門了，并要求大家在一個月之內搬走。為了堅持完成正在進行的研究，秀珍應聘到了一所小學擔任科學老師。由于秀珍班級的班主任懷孕休假，校領導不得不請秀珍頂替三個月，并說教案的事情藝恩老師會幫忙解決。

快上課的時候，藝恩老師將教案交給秀珍，說是他們班上養的鴨子死了，這節課就讓孩子們給死去的鴨子寫信，以此寄托和紓解孩子們悲傷的心情。課堂上，所有的孩子都在寫作文，只有慧珍沒有動筆，她認為鴨子死后根本就不會讀人們的信，而且這個世界上根本就沒有天國。其他的孩子聽到后七嘴八舌地討論起來，秀珍發現孩子們根本就沒有什么悲傷的情緒，于是讓孩子們自己決定要不要給鴨子寫信。下課后，孩子們像脫韁的野馬沖出教室，慧娜來到秀珍的身邊，將一封信交給了她。原來鴨子是因為班上調皮的男同學故意喂了不能吃的東西致死的。

第二天在課堂上，慧娜的同桌說自己不想在慧娜的面前吃飯，因為慧娜的指甲很臟，慧娜聞言趕緊將自己黑黑的指甲藏了起來。上課的時候，秀珍發現被舉報的兩個男同學欺負慧娜，于是將他們叫了出去半恐嚇半講理的讓他們不要欺負女生和動物。

下班后，秀珍獨自一人在飯店用餐，突然發現慧娜站在窗外看著自己。秀珍發現慧娜很多時候都是一個人生活，于是告訴她一定要把自己收拾的精神一些，不能讓別人一眼就看出自己是可以被隨意欺負的人。秀珍將自己為慧娜買的指甲剪拿給她，陪著她一起等待媽媽回來。突然一個撿破爛的老奶奶沖了出來大罵秀珍，拉著慧娜就走。慧娜回到家，與媽媽同居的男人正在打游戲，慧娜小心翼翼地進屋不讓自己發出任何聲音。

第二天上課的時候，秀珍發現慧娜不在，一問才知道慧娜居然因為營養不良而暈倒在廁所里，而且她的身上還有很多的傷口，藝恩老師擔心慧娜正在承受家庭暴力。秀珍去看慧娜，慧娜卻說這些都是自己摔的，自己很喜歡媽媽。放學后秀珍和藝恩去慧娜家家訪，發現慧娜被媽媽牽著回家，這次慧娜的耳朵受傷了，但慧娜卻說自己是在路邊玩被棒球打傷的。藝恩老師很想與慧娜媽媽溝通，發現慧娜媽媽的態度極為冷淡。為了讓老師相信自己是摔倒受傷的，慧娜甚至故意將自己摔在臺階上。

藝恩老師對慧娜的情況非常擔憂，于是將這件事情向學校進行了匯報，礙于慧娜和媽媽的證詞都是一樣的，現在就算是警察出面也無濟于事，領導只好將此事報告給警察，也聯系了專業的社會機構，讓老師保持一周一次的家訪頻率。秀珍覺得慧娜不愿說實話是因為不想失去媽媽的愛，建議暫時不要逼得太緊，可藝恩老師卻覺得這樣袖手旁觀不是好辦法。

晚上，警察到慧娜家進行情況核實，慧娜媽媽一臉不耐煩的讓躲在箱子里的慧娜出來，慧娜還是堅持自己是被路邊的棒球打傷的。回到房間，同居的男人把玩著棒球，媽媽低聲下氣的哀求著他不要再動慧娜。男人負氣出走，媽媽傷心的哭了，慧娜拍拍媽媽本想安慰她，可媽媽卻讓她不要讓自己看到，慧娜又躲回了箱子里。

秀珍的媽媽因為生病了讓載范將女兒找回來，載范查到了一些信息，媽媽讓他親自去看看，這讓載范很不理解。媽媽說在過去的時間里任由秀珍做自己喜歡的事情其實很累，自己現在突然生病，已經沒有那么多的時間了，拜托載范一定要將秀珍帶回來。這時尹珍推門進來，問十年來姐姐和他們毫無聯系，現在為什么一定要找到她，媽媽說自己現在不能說。

秀珍收到了冰島研究機構的邀請函，馬上就可以去那邊繼續自己的研究了。晚上，慧娜的媽媽回到家，發現慧娜被裝在垃圾袋里，而同居的男人正在打游戲。慧娜的媽媽生氣不已，但是同居的男人好像根本就沒有聽到一樣。媽媽拿了錢給慧娜讓她出去玩，慧娜一個人坐在路邊，被觀察候鳥回來的秀珍看到帶回了家。秀珍為慧娜做飯，陪著她讀書，給她講候鳥的趣事，兩人相約著要一起去看候鳥遷徙。慧娜依然對媽媽很維護，秀珍也沒有戳穿她。送慧娜回去的時候，秀珍看到了慧娜媽媽同居的男人正好從屋里出來。那人的眼神陰冷無比，這讓秀珍心里十分不安，于是找到之前的同事拜托他一定要幫她確認慧娜的安全。

秀珍向學校辭職了，放學的時候發現慧娜得知她要走非常不開心。慧娜回到家，發現自己的寵物死了，慧娜媽媽氣沖沖地說反正不是自己做的。慧娜回家后蜷縮在桌子下睡覺，同居的男人給她送來了包飯，一邊向她描述著自己殺死寵物的情景，一邊還不讓她流下一滴眼淚。男人給慧娜涂上口紅，又給她灑上香水，猥瑣的撫摸慧娜幼小的身體，這一幕剛好被回來的慧娜媽媽看到。慧娜跑向媽媽的身邊尋求安全感，可媽媽卻覺得她太臟了。

秀珍收拾東西的時候發現慧娜意外留下的筆記本，上面記載著她他最喜歡的東西，發現自己也在她的筆記本中。秀珍忍不住的來到慧娜的家門口，發現門邊的黑色垃圾袋發出微弱的聲響。秀珍打開一看，發現里面的慧娜渾身是傷。秀珍將慧娜帶回家了，這次她也選擇了和藝恩老師一樣的選擇。看著慧娜身上的累累傷痕，秀珍仿佛就看到了那個男人對她施暴的場景，這一切讓她都覺得觸目驚心。

慧娜醒過來了，她要秀珍帶她去看候鳥。就在看候鳥的海邊，慧娜將藏在心中的秘密說了出來，原來男人曾經將慧娜的幼兒園同學從四樓丟下去致死，還一直威脅慧娜要殺了她。慧娜拿著羽毛跑到了海里，一步步的向大海的深處走去，媽媽將她當做垃圾一樣裝進口袋，想要讓自己消失的事情讓她徹底寒心了，這次她想讓候鳥帶走自己，讓自己得到解脫。秀珍看到不對勁后跑過去將慧娜緊緊的抱住，問慧娜是否可以做到拋棄自己的母親，她會幫助慧娜活下去的。