約拿入住蒙特萊昂酒店，剛洗完澡便發現酒店房間有動靜，于是倉促將一份高級海軍機密文件塞到床墊底下，然后到陽臺查看，結果被人殺死在那里。道恩他們趕去現場調查時，只看到空的機密文件袋，而約拿則被人割了舌頭，房間里一片凌亂。

塞巴斯蒂安做彈道分析時，得知兇手用的子彈，是屬于北約成員專用子彈，而他也查出子彈屬于海豹突擊隊中的影子分隊使用的。洛蕾塔查到，約拿是胃潰瘍患者，遵醫囑應該吃清淡的食物，而她則在約拿的胃里發現的全是刺激性的食物。洛蕾塔對比約拿在酒店吃飯的餐單，發現他并沒有點辣的食物，所以她認為只要找到那個食物的來源，就能知道約拿報道的事件。

塞巴斯蒂安看了約拿之前的報道，認為他一定是掌握了什么想要說出來，而被人謀殺的。布羅迪根據約拿吃了三天的食物，去找老板埃德加了解約拿的事情，可埃德加并不肯承認他認識約拿。布羅迪跟埃德加糾纏了很久，才讓他埃德加說起了玻利維亞SAN MARTEL的大屠殺事件，直指約拿想要報道的就是海豹突擊隊員有人收了錢，殺死了他們的領導，并割掉了他們的舌頭。

布羅迪質問埃德加，想知道誰能證明他所說的話，埃德加于是把崔維斯的名字告訴布蘭迪。道恩去找了崔維斯，從他那里拿到了一些照片，證實了埃德加的說法，而那些照片也是約拿想辦法拿到的，只是崔維斯沒辦法透露照片的來源途徑。

就在道恩他們排查影子分隊里最有嫌疑的人員之時，格拉涅爾被人用與約拿同樣的方式殺死了，而這一次NCIS在格拉涅爾的車上找到了瑞安的毛發。經瑞安太太提供的線索，得知瑞安在國家公園附近出現，克里斯托弗便帶著索妮亞前去，結果在叢林里發現瑞安之時，遭到他的反抗，他們兩人都受了一些輕傷，讓瑞安逃跑了。

瑞安的妻子得知了瑞安的事情，她無論如何也不能相信NCIS對瑞安的指控，在她認為瑞安是一個絕對崇尚榮譽的人，寧死也不可能被指控是殺人狂魔。就在瑞安妻子對瑞安的指控產生質疑時，洛蕾塔也有新的發現，證實瑞安并不是殺死格拉涅爾的人，而就在此時塞巴斯蒂安發現，那些證明海豹突擊隊員參與大屠殺的照片是偽造的。

巴頓正在研究照片的時候，發現他們的文件正在被刪除，這才知道有人入侵了他們的電腦，他只能馬上追蹤對方的IP，讓道恩前去抓人。道恩按照巴頓提供的地址，抓住的正是崔維斯，可崔維斯卻自稱他是CIA的人員，什么也不肯告訴道恩他們。

塞巴斯蒂安在真實的照片中，發現了一個指紋，在系統掃描后發現，指紋是屬于埃德加的，他才是那個真正的屠殺者。找出了真相，道恩馬上聯系克里斯托弗，讓他把真相告訴逃亡的瑞安，瑞安這才把他們在保護行動犯的錯說出來。瑞安因為做錯的事，不肯跟克里斯托弗他們回去，克里斯托弗于是給瑞安一個將功補過的機會，讓他親手抓住埃德加，彌補他失去的榮譽。