施瑯率戰船于六月十六日到達澎湖，藍理率領的先鋒左營奪得八罩島泊船港。施瑯進軍的戰船很快在海上形成了多組品字形船隊，號炮連天劉國軒拼命抵抗，由于潮汛原因施瑯的戰船被擱淺，劉國軒命令集中兵力向施瑯帥船發起進攻，經眾將軍的全力拼命反擊，施瑯解危。首戰澎湖海受阻，八罩嶼錨地施瑯命令將臨陣退縮的詹六奇等人推出斬了，吳啟爵建議讓他們戴罪立功。施瑯率戰船和水師二萬多人屯結在八罩島，飲水問題已經影響軍心的穩定，施瑯決定組織一支兵馬挖井尋找新水源。當劉國軒還在開慶功會飲酒時候，天空突然打雷，六月一雷止九臺，劉國軒大驚，自知完了。