皇帝聽聞齊王遭追殺一事，龍顏大怒，命趙無極徹查此事，然后將齊王安置在他的敕宅潛龍邸中。齊王十分擔心養女蘇溢清的安危，請趙無極幫忙找尋。皇后與劉吉聽說皇帝已知曉齊王赴京途中的險情，慌亂不已，如若事情進一步泄露，彼時兩人都將人頭不保。于是他們決定抹去痕跡，殺人滅口以求自保。

墜崖的申力行和蘇溢清僥幸得生，漂在運河中為通州臨河村村民所救，申力行被父親的故交大夫留在自己的醫館療傷。醒來的蘇溢清立刻就要趕往京城。

追查而至的方毅帶人闖入醫館，殺了一個醫館弟子仍搜尋無果，大為光火，于是縱火焚毀了醫館，申力行與醫館大夫躲藏在地窖不敢出聲，在濃煙烈火中昏厥。蘇益清行至起火的醫館前被方毅發現，逃入林間終遭包圍，眼見著插翅難飛。正當情況急轉而下，千鈞一發之時，東廠高手趕來救下了她。

在潛龍邸安頓下的齊王謝絕了眾大臣的拜會，閣老劉吉卻執意要見齊王。齊王無奈接見了劉吉，劉吉信誓旦旦地稱已經找到了一路來追殺齊王的殺手，請齊王一道前往驗查。

幸免于難的申力行醒來看見父親申梓木（黃文豪 飾）。申梓木知曉了因為申力行，醫館被毀，醫館弟子遇害，頓覺感覺無比愧疚，憤怒之下扇了兒子好幾耳光，在一旁的人勸阻和申力行的趕忙認錯之下，看著兒子受了箭傷才暫且住手。聞說申力行攪進齊王一事，又驚又怒。之后申力行想要去找父親的弟子言亦冬（應昊茗 飾），讓其助自己加入六扇門，這受到了身為六扇門統帶的父親申梓木的堅決反對，申梓木想讓他好好做個地主，只要平平安安守成家業就行。

抵達大牢，狡詐的劉吉與手下的錦衣衛都指揮使劉進（周帥 飾）先給齊王上演了一出苦肉計，然后拉來幾具面目全非滿身傷痕的尸體，將事情歸罪于一些江湖草莽身上。齊王明眼，早已識破原委，但未戳穿他他們。劉吉看齊王的態度捉摸不透，且知曉其睚眥必報的風格，這更加堅定了他殺人滅口抹去痕跡的決心。

言亦冬趕來找到師傅申梓木，想請其幫助偵破一起發生在京城的兇殺案。申力行與看望自己的嚴亦冬談論理想抱負，嘆息空有一身本事卻無門施展，表示現在的生活非自己想要。申力行青梅竹馬的未婚妻龔芮溪（龔芮溪 飾?）此時進來，以為申力行不想要自己，惱羞不已，又是撒嬌又是嗔怪。申力行對于自己的這個未婚妻頗為吃不消。

劉吉以錦衣衛百戶之位相許，指使方毅昔日手下孫乾殺掉方毅滅口。利欲熏心的孫乾完全不念及往恩舊情，帶著手下圍殺了方毅，取下方毅身上的錦衣衛百戶銘牌，取代了他的位置。

申梓木、言亦冬與仵作一起驗尸。根據死者黑黃的牙齒，申梓木判斷此人生前是個大煙鬼，經常吸食大煙。至于其而下體受過閹割的跡象和面部密密麻麻的刀傷，那只是欲蓋彌彰，為了達到干擾六扇門查驗真相的目的，死者肋部的刀傷才是是身上的致命傷。于是，申梓木讓嚴亦冬發動關系，去查查宮里頭最近有沒有失蹤的公公。

蘇溢清終于抵達京城，找到了齊王，并向齊王引薦化名為程咬金的申力行，說是申力行救了她，希望齊王把申力行作為立足京城的心腹。齊王也表示一定會找到申力行以報恩情，不過自己并不想久留京城，他想要回到濟南封地，安心當個藩王。

趙無極上門拜會。聞說齊王的萌生退意，趙無極告訴齊王，只要其離開京城，那便絕無幸理。